У вас есть текстурная развертка вашей модели? http://foxter.ru/showthread.php?p=67560#163. Если есть, то в Фотошопе делаете карту прозрачности. Например лист дерева сделанный на прямоугольнике...нам нужно часть этого прямоугольника сделать невидимым, рисуем карту (черные области будут прозрачными. а белые останутся непрозрачными):